Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp8Q80U87 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp8Q80U87 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp8Q80U87 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp8Q80U87 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp8Q80U87 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Usp8Q80U87 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp8Q80U87 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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