Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rexo1Q7TT28 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rexo1Q7TT28 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms