Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Dsg1bQ7TSF1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Dsg1bQ7TSF1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dsg1bQ7TSF1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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