Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN22

Txndc16, Thioredoxin domain-containing protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc16Q7TN22 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Txndc16Q7TN22 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Txndc16Q7TN22 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms