Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trappc6aQ78XR0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trappc6aQ78XR0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trappc6aQ78XR0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Trappc6aQ78XR0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Trappc6aQ78XR0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trappc6aQ78XR0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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