Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Znf653Q6YND2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms