Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Timd4Q6U7R4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Timd4Q6U7R4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Timd4Q6U7R4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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