Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CtifQ6PEE2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CtifQ6PEE2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms