Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PdgfrlQ6PE55 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PdgfrlQ6PE55 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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