Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Asic1Q6NXK8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms