Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q6DFW0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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