Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rftn1Q6A0D4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rftn1Q6A0D4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms