Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cntn4Q69Z26 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms