Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PtprdQ64487 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PtprdQ64487 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PtprdQ64487 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtprdQ64487 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PtprdQ64487 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PtprdQ64487 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprdQ64487 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprdQ64487 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprdQ64487 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprdQ64487 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtprdQ64487 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtprdQ64487 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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