Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim24Q64127 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim24Q64127 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim24Q64127 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Trim24Q64127 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim24Q64127 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim24Q64127 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms