Protein–RNA interactions for Protein: Q64124

Scx, Basic helix-loop-helix transcription factor scleraxis, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScxQ64124 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
ScxQ64124 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms