Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vat1Q62465 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vat1Q62465 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms