Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sycp1Q62209 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms