Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Ssr4Q62186 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssr4Q62186 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms