Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sema3cQ62181 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sema3cQ62181 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms