Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

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Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
VcanQ62059 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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VcanQ62059 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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VcanQ62059 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VcanQ62059 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VcanQ62059 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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VcanQ62059 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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VcanQ62059 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
VcanQ62059 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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