Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cacna1eQ61290 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cacna1eQ61290 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms