Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ripk1Q60855 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ripk1Q60855 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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