Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Arcn1Q5XJY5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms