Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Trim38Q5SZ99 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim38Q5SZ99 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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