Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Vmn1r195Q5SVD6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms