Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynrgQ5SV85 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynrgQ5SV85 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms