Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc42Q5SV66 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms