Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znrf3Q5SSZ7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms