Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf215Q5SPX3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms