Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ttf2Q5NC05 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ttf2Q5NC05 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms