Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vps41Q5KU39 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms