Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrrc8bQ5DU41 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms