Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Xirp2Q4U4S6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms