Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tigd5Q499M4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms