Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc160Q3UYG1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms