Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skap1Q3UUV5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap1Q3UUV5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms