Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp560Q3URI6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms