Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Gm5460Q3UQ97 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5460Q3UQ97 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm5460Q3UQ97 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5460Q3UQ97 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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