Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdgfl2Q3UMU9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms