Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cog7Q3UM29 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cog7Q3UM29 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms