Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc34Q3UI66 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms