Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LchnQ3UHG7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LchnQ3UHG7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms