Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHF3

Mier3, Mesoderm induction early response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mier3Q3UHF3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mier3Q3UHF3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms