Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Garem1Q3UFT3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms