Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rnf40Q3U319 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rnf40Q3U319 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
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Rnf40Q3U319 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnf40Q3U319 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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