Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Kdm4dQ3U2K5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Kdm4dQ3U2K5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms