Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pag1Q3U1F9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pag1Q3U1F9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.5 ms