Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYU2

Atp13a5, Probable cation-transporting ATPase 13A5, mousemouse

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a5Q3TYU2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp13a5Q3TYU2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Atp13a5Q3TYU2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms