Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrrc28Q3TX51 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms